Charakteristika
História katedry
Základy vzniku Katedry mikrobiológie FBP SPU v Nitre sú spojené so vznikom Ústavu fytopatológie a bakteriológie v roku 1946, ktorý bol súčasťou Vysokej školy poľnohospodárskeho a lesníckeho inžinierstva v Košiciach a Fakulty poľnohospodárskeho inžinierstva. Od vzniku samostatnej Vysokej školy poľnohospodárskej v Nitre v roku 1952 bola vytvorená katedra ochrany rastlín s úsekom mikrobiológie, kde sa vyučoval predmet Bakteriológia všeobecná a poľnohospodárska. Samostatná katedra mikrobiológie vznikla v roku 1963 odčlenením od katedry ochrany rastlín a viedol ju prof. Ing. Drahomír Marendiak, CSc. až do roku 1972, kedy bola spolu s ďalšími 18-timi katedrami zrušená. Priestorové požiadavky katedry boli splnené v roku 1964, kedy sa presťahovala z Misijného domu na Kalvárii do súčasných priestorov SPU na tr. A. Hlinku. V ďalších rokoch vrámci reorganizačných zmien bola zlúčená s katedrou fyziológie rastlín a katedrou botaniky na katedru rastlinnej biológie, v akad. r. 1977/78 sa odčlenila katedra botaniky a zostala katedra fyziológie rastlín a mikrobiológie, v akad. r. 1982/83 sa katedra fyziológie rastlín odčlenila a vznikla katedra ochrany životného prostredia a mikrobiológie. Opäť po revolučnom roku 1989 nadobudla v roku 1990 svoju pôvodnú samostatnosť ako Katedra mikrobiológie Agronomickej fakulty Vysokej školy poľnohospodárskej v Nitre (od roku 1997 Slovenskej poľnohospodárskej univerzity) pod vedením doc. Ing. Ľudmily Kopčanovej, CSc. (1990-1994) a doc. Ing. Tatiany Števlíkovej, CSc. (1994-2003). Od 1.1. 2003 sa katedra stala súčasťou Fakulty biotechnológie a potravinárstva SPU v Nitre a vedúcou katedry sa stala doc. Ing. Soňa Javoreková, PhD. Katedra má v súčasnom období obsadených 7 pedagogických miest,5 technických a 2 robotnícke. Pre všetkých študentov SPU a to najmä fakúlt, ktoré sú biologicky zamerané ponúka a vyučuje 10 predmetov na I. a II. stupni VŠ štúdia, 3 predmety na III. stupni štúdia a 2 predmety v anglickom jazyku na I. stupni štúdia. Vedecko-výskumná činnosť katedry je orientovaná ako na poľnohospodársku výrobu (rastlinnú a živočíšnu oblasť), tak i oblasť agropotravinárstva, biotechnológie a tiež aplikovanej biológie.
Vedecká činnosť
Výskumná činnosť katedry je zameraná na nasledovné oblasti:
Pôdnu mikrobiológiu so zameraním na chemickú a biologickú charakteristiku poľnohospodársky využívaných pôd. Zameriavame sa najmä na sledovanie zmien mikrobiálneho spoločenstva v orných pôdach a pasienkoch s rôznym spôsobom obhospodarovania, v rizosférovej a fylosférovej oblasti rastlín, intenzívne hnojených, poprípade inak zaťažených pôd prítomnosť xenobiotík. Z ukazovateľov kvality a zdravia pôdy sledujeme základné chemické charakteristiky (pH, vlhkosť, nitrifikačná aktivita, Ntot, Nan, Nbiol, Cox) a biologické charakteristiky (Chwl, rozklad celulózy, produkcia CO2, veľkosti biomasy pôdnych mikroorganizmov, enzýmové aktivity-FDA hydrolýza, dehydrogenázová aktivita, fosfatázová aktivita) a tiež početné zastúpenie dôležitých fyziologických skupín mikroorganizmov v pôde. Systémom BIOLOG uskutočňujeme hodnotenie fyziologickej diverzity mikroorganizmov a metódou PCR DGGE hodnotíme genetickú diverzitu prítomných mikroorganizmov.
Kontaktné osoby: Ing. Jana Maková, PhD., doc. Ing. Soňa Javoreková, PhD., Ing. Juraj Medo, PhD.
Mykologickú kontamináciu potravín, krmív a prostredia so zameraním na mykologické vyšetrenie rastlinných produktov (predovšetkým obilnín), kŕmnych zmesí a ich komponentov. Sleduje sa kvantitatívne výskyt mikroskopických húb, uskutočňuje sa ich izolácia a identifikácia, stanovenie toxinogenity: druhov rodu Aspergillus a príslušných teleomorf (aflatoxín B1, G1, ochratoxín, patulín, citrinín, fumagilín), druhov rodu Penicillium (citrinín, ochratoxín A, indolové deriváty), Fusarium (deoxynivalenol, diacetoxyscirpenol, fumonizín B1, HT-2 toxín, moniliformín, T-2 toxín, zearalenon), Alternaria (altenuén, alternáriol, alternáriol monometyléter). V uvedených komoditách sledujeme aj aktivitu vody. Zaoberáme sa aj mykotickou kontamináciou prostredia, so zameraním na identifikáciu pôvodcov zaplesnivenia v pracovnom prostredí, ale i v domácnostiach.
Kontaktné osoby: doc. Ing. Dana Tančinová, PhD., Ing. Soňa Felšőciová, PhD., Ing. Z. Mašková PhD.
Mikroflóru tráviaceho traktu živočíchov a živočíšnych produktov
V rámci výskumných projektov a katedrálneho výskumu sledujeme osídlenie gastrointestinálneho traktu hydiny po aplikácii probiotických a prebiotických preparátov, biologicky aktívnych zložiek, látok prirodzeného pôvodu a prírodných látok ako sú rastlinné silice a včelie produkty - peľ a propolis. Zameriavame sa na identifikáciu druhov rodu Lactobacillus, Enterococcus a zástupcov čeľade Enterobacteriaceae ako i ďalších rodov s využitím PCR a fluorescenčnej mikroskopie. Sledujeme antimikrobiálnu rezistenciu črevnej mikroflóry vo vzťahu k bezpečnosti potravín živočíšneho pôvodu. Zaoberáme sa izoláciou a identifikáciou zástupcov enterokokov, laktobacilov a mikroorganizmov z čeľade Enterobacteriaceae, ktoré sú testované na rezistenciu proti 12 rôznym antibiotikám. Testujeme antimikrobiálne účinky včelích produktov na rôzne druhy mikroorganizmov s využitím klasickej difúznej metódy a metódy minimálnej inhibičnej koncentrácie MIC. Objektom nášho výskumu je aj optimalizácia metód klasickej screeningovej metódy s TECRA Uniqua a Real time PCR pre identifikáciu rôznych druhov patogénov. Zaoberáme sa aj mikrobiologickou kvalitou peľu a medu so zameraním na rôzne druhy mikroorganizmov, s využitím klasických, ako aj PCR metód.
Kontaktné osoby: doc. Ing. Miroslava Kačániová, PhD.
Služby a poradenstvo pre prax
Pracovníci Katedry mikrobiológie zabezpečujú poradenstvo v oblasti:
- mykologickej kontroly kvality kŕmnych zmesí (doc. Ing. D. Tančinová, PhD., Ing. Z. Mašková PhD.)
- mikrobiologickej kontroly kvality potravín (doc. Ing. D. Tančinová, PhD., doc. Ing. M. Kačániová, PhD., Ing. S. Felšőciová, PhD., Ing. Z. Mašková PhD.)
- pôdnej mikrobiológie (doc. Ing. S. Javoreková, PhD., Ing. J. Maková, PhD., Ing. J.Medo, PhD.)
- mikrobiologickej a chemickej kvality povrchových, pitných a závlahových vôd (Ing. J. Maková, PhD., doc. Ing. S. Javoreková, PhD.)
- metód mikrobiologického skúšania potravín (Ing. J. Maková, PhD.)
- biodegradačnej schopnosti plastov a iných xenobiotík v pôde (doc. Ing. S. Javoreková, PhD.)
- mykotickej kontaminácie pracovného prostredia a prostredia domácností (doc. Ing. D. Tančinová, PhD., Ing. Z. Mašková PhD.)
